燃燒效率基於種種因素會影響效率值的變化，不管是燃料的供給、風量的調配、甚至是鍋爐燃燒室的尺寸、海拔地理位置，這些因素都會影響到燃燒的效率及後端排放污染物的產生。
燃燒主要由前次提到的「燃燒三要素」控制，當「燃點」完成引燃後，最主要的調配就落到「氧氣」供應及「燃料」的供應。
氧量不足，給予的氧分子不夠時，氧分子跟多餘的碳不好結合，進而拆解氧分子，導致CO的產生，也就是前次有提到的「燃燒不完全」。
在「燃燒三要素」也有提到，氧量增加會使燃燒的火焰更加劇烈，但也會加速燃料的消耗，對於節省燃料為主的工業來說，其實是不樂見的。
根據使用的燃燒器控制方式不同，工程師會有不一樣的調整方式。
這邊以電子比例式為例，在實際使用前，工程師會於控制器中預設燃燒曲線，也就是預設風量調節閥開度(風門)及燃料調節閥的開度(瓦斯閥門)，讓燃燒機在運轉狀態中開大關小有跡可循，配合工程師現場狀況調整風門及瓦斯閥門的角度，來製造最「適切」的燃燒效率。
與鍋爐效率不同，燃燒效率毋須加購裝置或換新設備，效率調整僅在現場就能做到，但還是會根據現場設備的性能有所受限。
早期的工程師依據自身經驗，透過火焰的顏色、形狀去調整燃燒的效率值及排放物的產出，燃燒效率端憑老師傅的經驗決定。
現今工程師大多配備有燃燒效率分析儀來輔助調整，效率值變得比較科學及可視化，也更能掌握燃燒後的產出物。
什麼能夠定義燃燒效率呢?基礎來說，我們只要提供足夠的氧氣量，讓燃燒的炭基能夠與氧氣完全結合，產出CO2，就是達到燃燒效率100%。
進一步定義燃燒效率好壞，可以用我們方才有提到的「氧氣量」，也就是業界所說的O2值，這邊的O2值，並非指源頭供給的氧氣量，而是指燃燒過後煙氣所殘留下來的O2殘量，這個數值可透過燃燒效率分析儀做驗證。
怎麼樣才是最「適切」的燃燒效率呢? 舉常見燃料天然氣來說，最適切的O2殘餘量落在3-6%，據統計在3%左右的殘餘氧量，可以實際降低燃料的浪費。燃油則是6%左右。
順帶一提，法規基礎檢驗各項污染產出的O2值設定在6%，會用6%的基礎值來檢驗各項污染物的產出值。
調整其實並非一件容易的事，風量過大容易導致熄火，風量過小也容易導致熄火，並會造成燃料於爐膛內蓄積，造成危險，還請調整的時候拜託專業的燃燒機/鍋爐廠家委派工程師做調節。
燃燒效率也會因季節的不同有所改變，主要是因為進入燃燒機的空氣溫度改變，導至進入的氧含量有變化，由於熱脹冷縮的緣故，同樣的機器在相同環境下的燃燒曲線設定，所得的O2殘值在冬天較高，夏天較低。
也會因為風門、瓦斯閥門年久未保養，導致運轉誤差，進一步影響燃燒效率。
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